До складу Інституту входять п’ять кафедр:
- Кафедра квантової радіофізики;
- Нанофізики конденсованих середовищ;
- Супрамолекулярної хімії;
- Молекулярної біотехнології та біоінформатики;
- Фізика високих технологій та електроніки.
Та науково-дослідні лабораторії:
- Фізика і техніка напівпровідників;
- Методи дослідження властивостей матеріалів та структур на їх основі;
- Хіміко-біологічні методи дослідження матеріалів;
- Технології та дослідження матеріалів і структур.